Turnamen pra musim Piala Presiden 2019 bakal digelar pada 2 Maret-12 April 2019 mendatang. Sebanyak lima kota ditunjuk sebagai tuan rumah dan diikuti 20 klub terbaik di Indonesia, 18 dari klub Liga 1 dan 2 klub Liga 2.

Pada babak penyisihan grup, Borneo FC tergabung dalam grup D bersama tuan rumah PSS Sleman, Persija Jakarta dan Madura United. Borneo FC dipertandingan pertama akan melawan Madura United, pada 5 Maret 2019 pukul 19.30 WITA.

Dilanjutkan pertandingan kedua melawan PSS Sleman pada 10 Maret 2019, pukul 19.30 WITA. Sebelum akhirnya menutup babak penyisihan dengan bersua juara Liga 1 2018, Persija Jakarta, 15 Maret 2019, pukul 16.30 WITA. Seluruh pertandingan akan dilaksanakan di Stadion Maguwoharjo Sleman.

Jika mampu lolos dari babak penyisihan, Borneo FC akan bermain di babak 8 besar dengan memakai sistem single match, dimana klub dengan peringkat terbaik di grup penyisihan ditunjuk sebagai tuan rumah. Selanjutnya, di babak semifinal dan final akan memakai sistem home away. (TAN)